Особняк "Дом Чаплыгина" расположен в Центральном административном округе, район Басманный. Ближайшие станции метро "Красные ворота", "Курская". Недалеко расположена улицы Покровка и Земляной Вал, расстояние до Садового кольца около 500 метров, до Третьего транспортного кольца - около 2,5 километра.